Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms