Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms