Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CC2D2AQ9P2K1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CC2D2AQ9P2K1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CC2D2AQ9P2K1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms