Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHPF2Q9P2E5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHPF2Q9P2E5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms