Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PRO2289Q9P1D8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms