Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAPAQ9P0L0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms