Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGPEP1Q9NXJ5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms