Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CWC25Q9NXE8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms