Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT84Q9NSB2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms