Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DUOX1Q9NRD9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DUOX1Q9NRD9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms