Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms