Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms