Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASS4Q9NQ75 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms