Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms