Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJC4Q9NNZ3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms