Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAVER2Q9HCJ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAVER2Q9HCJ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms