Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms