Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms