Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NYXQ9GZU5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms