Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFDQ9GZP0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFDQ9GZP0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms