Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCL11BQ9C0K0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCL11BQ9C0K0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms