Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP44Q9C0F1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms