Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms