Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRP1Q9C000 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms