Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYCP2Q9BX26 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP2Q9BX26 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms