Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms