Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SGIP1Q9BQI5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGIP1Q9BQI5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms