Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JMJD8Q96S16 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms