Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EAF1Q96JC9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms