Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAX2Q96IS3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms