Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms