Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MALSU1Q96EH3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MALSU1Q96EH3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms