Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIGD2Q96BF3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms