Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC102AQ96A19 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC102AQ96A19 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms