Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-CQ95604 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms