Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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USP6NLQ92738 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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USP6NLQ92738 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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USP6NLQ92738 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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USP6NLQ92738 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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USP6NLQ92738 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP6NLQ92738 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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USP6NLQ92738 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP6NLQ92738 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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