Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERVK_113Q902F9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms