Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms