Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
U2AF1L4Q8WU68 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms