Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms