Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIEQ8NEW7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TMIEQ8NEW7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIEQ8NEW7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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