Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC112Q8NEF3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms