Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HJURPQ8NCD3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms