Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PNLDC1Q8NA58 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms