Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHCHD4Q8N4Q1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHCHD4Q8N4Q1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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