Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms