Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2LQ8IYA6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms