Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLF2Q8IX21 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLF2Q8IX21 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms