Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IGDCC3Q8IVU1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms