Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF550Q7Z398 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF550Q7Z398 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms